| Дата | Этап | Соперник | Счет | Место | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 07.05.2016, Сб, 15:00 | Зенит Иркутск | 1:7 П | Выезд | Иркутск, Стадион "Зенит" | ||
| 09.05.2016, Пн, 13:00 | Чита-М Чита | 3:1 В | Выезд | Чита | ||
| 15.05.2016, Вс | Сибирь-М Новосибирск | 0:0 Н | Дома | Барнаул | ||
| 27.05.2016, Пт, 17:00 | Енисей-М Красноярск | 3:3 Н | Выезд | Красноярск, Стадион "Футбол-Арена "Енисей" | ||
| 29.05.2016, Вс, 17:00 | Рассвет-Реставрация Красноярск | 2:2 Н | Выезд | Красноярск, Стадион "Рассвет" | ||
| 03.06.2016, Пт, 18:30 | Новокузнецк Новокузнецк | 0:1 П | Дома | Барнаул, Стадион Алексея Смертина | ||
| 05.06.2016, Вс, 18:00 | Распадская Междуреченск | 0:7 П | Дома | Барнаул | ||
| 24.06.2016, Пт | СДЮСШОР Кемерово | 1:1 Н | Дома | Барнаул | ||
| 26.06.2016, Вс | Шахтер Прокопьевск | 1:1 Н | Дома | Барнаул | ||
| 08.07.2016, Пт, 18:30 | Бийск Бийск | 3:0 В | Выезд | Бийск, Стадион "Юбилейный" | ||
| 26.07.2016, Вт | Чита-М Чита | 1:3 П | Дома | Барнаул | ||
| 05.08.2016, Пт, 18:00 | СДЮСШОР Кемерово | 3:3 Н | Выезд | Кемерово | ||
| 07.08.2016, Вс, 18:00 | Шахтер Прокопьевск | 0:1 П | Выезд | Прокопьевск | ||
| 11.08.2016, Чт, 19:00 | Сибирь-М Новосибирск | 2:2 Н | Выезд | Новосибирск, Стадион "Спартак" | ||
| 14.08.2016, Вс | Сибиряк Братск | 3:1 В | Дома | Барнаул | ||
| 02.09.2016, Пт, 18:00 | Новокузнецк Новокузнецк | 0:1 П | Выезд | Новокузнецк, Стадион "Металлург" | ||
| 04.09.2016, Вс, 15:00 | Распадская Междуреченск | 1:2 П | Выезд | Междуреченск, Стадион "Томусинец" | ||
| 10.09.2016, Сб | Зенит Иркутск | 3:1 В | Дома | Барнаул | ||
| 16.09.2016, Пт | Енисей-М Красноярск | 2:1 В | Дома | Барнаул | ||
| 18.09.2016, Вс | Рассвет-Реставрация Красноярск | 0:2 П | Дома | Барнаул | ||
| 24.09.2016, Сб | Сибиряк Братск | 1:1 Н | Выезд | Братск | ||
| 30.09.2016, Пт | Бийск Бийск | 3:2 В | Дома | Барнаул | ||
Указанное время матчей — барнаульское (МСК+4)