| Дата | Этап | Соперник | Счет | Место | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 07.08.2016, Вс, 15:00 | 1 тур | Чита Чита | 2:0 В | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 10.08.2016, Ср, 15:00 | 2 тур | Зенит Иркутск | 1:0 В | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 17.08.2016, Ср, 18:30 | 3 тур | Динамо Барнаул | 0:1 П | Выезд | Барнаул, Стадион "Динамо" | |
| 20.08.2016, Сб, 17:00 | 4 тур | Иртыш Омск | 5:0 В | Выезд | Омск, БУ СК "Красная звезда" | |
| 01.09.2016, Чт, 14:00 | 6 тур | Смена Комсомольск-на-Амуре | 1:1 Н | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 08.09.2016, Чт, 14:30 | 7 тур | Смена Комсомольск-на-Амуре | 2:0 В | Выезд | Комсомольск-на-Амуре, Стадион "Металлург" | |
| 18.09.2016, Вс, 13:00 | 9 тур | Иртыш Омск | 1:0 В | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 21.09.2016, Ср, 14:00 | 10 тур | Динамо Барнаул | 1:1 Н | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 29.09.2016, Чт, 16:30 | 11 тур | Зенит Иркутск | 2:1 В | Выезд | Иркутск, Стадион "Труд" | |
| 02.10.2016, Вс, 13:00 | 12 тур | Чита Чита | 1:1 Н | Выезд | Чита, Стадион "Локомотив" | |
| 09.10.2016, Вс, 14:00 | 13 тур | Чита Чита | 1:3 П | Дома | Южно-Сахалинск | |
| 12.10.2016, Ср, 14:00 | 14 тур | Зенит Иркутск | 1:1 Н | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 20.04.2017, Чт, 18:30 | 15 тур | Динамо Барнаул | 0:1 П | Выезд | Барнаул, Стадион "Динамо" | |
| 23.04.2017, Вс, 17:00 | 16 тур | Иртыш Омск | 3:1 В | Выезд | Омск, БУ СК "Красная звезда" | |
| 03.05.2017, Ср, 15:00 | 18 тур | Смена Комсомольск-на-Амуре | 3:3 Н | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 11.05.2017, Чт, 15:00 | 19 тур | Смена Комсомольск-на-Амуре | 1:2 П | Выезд | Комсомольск-на-Амуре, Стадион "Металлург" | |
| 21.05.2017, Вс, 15:00 | 21 тур | Иртыш Омск | 3:0 В | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 24.05.2017, Ср, 15:00 | 22 тур | Динамо Барнаул | 1:2 П | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 31.05.2017, Ср, 17:00 | 23 тур | Зенит Иркутск | 1:1 Н | Выезд | Иркутск | |
| 03.06.2017, Сб, 15:00 | 24 тур | Чита Чита | 0:2 П | Выезд | Чита | |
Указанное время матчей — барнаульское (МСК+4)