| Дата | Этап | Соперник | Счет | Место | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 15.07.2012, Вс, 17:00 | 1 тур | Байкал Иркутск | 0:1 П | Выезд | Иркутск, Стадион "Локомотив" | |
| 18.07.2012, Ср, 16:30 | 2 тур | Чита Чита | 0:1 П | Выезд | Чита, Стадион "Локомотив" | |
| 24.07.2012, Вт, 14:30 | 3 тур | Смена Комсомольск-на-Амуре | 1:0 В | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 27.07.2012, Пт, 14:30 | 4 тур | Амур-2010 Благовещенск | 1:1 Н | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 05.08.2012, Вс, 17:00 | 5 тур | Сибиряк Братск | 2:2 Н | Выезд | Братск, Стадион "Металлург" | |
| 08.08.2012, Ср, 18:00 | 6 тур | Сибирь-2 Новосибирск | 1:1 Н | Выезд | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 17.08.2012, Пт, 17:00 | 7 тур | Якутия Якутск | 0:1 П | Выезд | Якутск, Стадион «Туймаада» | |
| 27.08.2012, Пн, 13:30 | 9 тур | Динамо Барнаул | 3:3 Н | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 30.08.2012, Чт, 13:30 | 10 тур | Иртыш Омск | 2:1 В | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 06.09.2012, Чт, 13:30 | 11 тур | Луч-Энергия Владивосток | 1:1 Н | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 12.09.2012, Ср, 16:00 | 12 тур | Луч-Энергия Владивосток | 2:2 Н | Выезд | Владивосток, Стадион "Динамо" | |
| 19.09.2012, Ср, 14:30 | 13 тур | Смена Комсомольск-на-Амуре | 1:2 П | Выезд | Комсомольск-на-Амуре, Стадион "Авангард" | |
| 22.09.2012, Сб, 16:30 | 14 тур | Амур-2010 Благовещенск | 1:0 В | Выезд | Благовещенск, Стадион "Амур" | |
| 29.09.2012, Сб, 12:00 | 15 тур | Сибиряк Братск | +:- В | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 02.10.2012, Вт, 13:00 | 16 тур | Сибирь-2 Новосибирск | 0:0 Н | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 08.10.2012, Пн, 14:00 | 17 тур | Якутия Якутск | 0:0 Н | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 17.10.2012, Ср, 16:30 | 19 тур | Динамо Барнаул | 3:0 В | Выезд | Барнаул, Стадион "Динамо" | |
| 20.10.2012, Сб, 17:00 | 20 тур | Иртыш Омск | 1:0 В | Выезд | Омск, БУ СК "Красная звезда" | |
| 26.10.2012, Пт, 12:00 | 21 тур | Байкал Иркутск | 2:1 В | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 29.10.2012, Пн | 22 тур | Чита Чита | 1:0 В | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 22.04.2013, Пн, 17:00 | 23 тур | Байкал Иркутск | 2:1 В | Выезд | Иркутск, Стадион "Локомотив" | |
| 25.04.2013, Чт, 16:30 | 24 тур | Чита Чита | 0:0 Н | Выезд | Чита, Стадион "Локомотив" | |
| 30.04.2013, Вт, 14:00 | 25 тур | Смена Комсомольск-на-Амуре | 0:0 Н | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 03.05.2013, Пт | 26 тур | Амур-2010 Благовещенск | 2:0 В | Дома | ||
| 09.05.2013, Чт | 27 тур | Сибиряк Братск | 1:0 В | Выезд | Братск | |
| 12.05.2013, Вс | 28 тур | Сибирь-2 Новосибирск | 3:0 В | Выезд | Новосибирск | |
| 18.05.2013, Сб, 14:00 | 29 тур | Якутия Якутск | 0:1 П | Выезд | Якутск, Стадион «Туймаада» | |
| 28.05.2013, Вт, 14:30 | 31 тур | Динамо Барнаул | 3:1 В | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 31.05.2013, Пт, 14:30 | 32 тур | Иртыш Омск | 3:1 В | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
| 05.06.2013, Ср, 14:30 | 33 тур | Луч-Энергия Владивосток | 3:2 В | Дома | Южно-Сахалинск, Стадион "Спартак" | |
Указанное время матчей — барнаульское (МСК+4)