| Дата | Этап | Соперник | Счет | Место | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 29.05.2016, Вс, 18:00 | 1 тур | Строитель Бийск | 2:1 В | Дома | Горно-Алтайск, Стадион "Динамо" | |
| 11.06.2016, Сб, 18:00 | 2 тур | Динамо-М Барнаул | 3:1 В | Выезд | Барнаул, Стадион "ДЮСШ "Динамо" (верхнее поле) | |
| 02.07.2016, Сб, 19:00 | 3 тур | Торпедо Рубцовск | 3:0 В | Дома | Горно-Алтайск, Стадион "Динамо" | |
| 10.07.2016, Вс, 19:00 | 5 тур | Алтай Барнаул | 10:0 В | Дома | Горно-Алтайск, Стадион "Динамо" | |
| 31.07.2016, Вс, 19:00 | 7 тур | Ника Бийск | 3:2 В | Выезд | Бийск, Стадион "Юбилейный" | |
| 14.08.2016, Вс, 17:30 | 8 тур | Динамо-М Барнаул | 1:5 П | Дома | Горно-Алтайск, Стадион "Динамо" | |
| 21.08.2016, Вс, 17:00 | 9 тур | Строитель Бийск | 2:2 Н | Выезд | Бийск, Стадион "Юбилейный" | |
| 28.08.2016, Вс, 17:00 | 10 тур | Торпедо Рубцовск | 0:3 П | Выезд | Рубцовск, Стадион "Торпедо" | |
| 09.09.2016, Пт, 20:00 | 6 тур | РАДО Бийск | 2:1 В | Выезд | Бийск, Стадион "Юбилейный" | |
| 11.09.2016, Вс, 17:00 | 12 тур | Алтай Барнаул | 1:1 Н | Выезд | Барнаул, Стадион СДЮШОР А. Смертина (центральное поле) | |
| 25.09.2016, Вс, 17:00 | 13 тур | РАДО Бийск | 2:0 В | Дома | Горно-Алтайск, Стадион "Динамо" | |
| 02.10.2016, Вс, 16:00 | 14 тур | Ника Бийск | 2:4 П | Дома | Горно-Алтайск, Стадион "Динамо" | |
Указанное время матчей — барнаульское (МСК+4)