| Дата | Этап | Соперник | Счет | Место | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| 23.04.2011, Сб, 17:00 | 1 тур | КУЗБАСС Кемерово | 0:2 П | Выезд | Кемерово | |
| 26.04.2011, Вт | 2 тур | Металлург-Кузбасс Новокузнецк | 0:3 П | Выезд | Новокузнецк | |
| 04.05.2011, Ср | 3 тур | Радиан-Байкал Иркутск | 0:2 П | Дома | Новосибирск | |
| 07.05.2011, Сб | 4 тур | Чита Чита | 2:0 В | Дома | Новосибирск | |
| 15.05.2011, Вс | 5 тур | Иртыш Омск | 1:1 Н | Выезд | Омск | |
| 18.05.2011, Ср, 18:30 | 6 тур | Динамо Барнаул | 0:5 П | Выезд | Барнаул, Стадион "Динамо" | |
| 26.05.2011, Чт | 7 тур | Мостовик-Приморье Уссурийск | 1:1 Н | Дома | Новосибирск | |
| 29.05.2011, Вс | 8 тур | Сахалин Южно-Сахалинск | 1:3 П | Дома | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 05.06.2011, Вс | 9 тур | Якутия Якутск | 2:3 П | Выезд | Якутск | |
| 20.06.2011, Пн, 18:00 | 12 тур | Сибиряк Братск | 3:2 В | Дома | Новосибирск | |
| 27.06.2011, Пн, 18:00 | 13 тур | Амур-2010 Благовещенск | 1:2 П | Дома | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 30.06.2011, Чт, 18:00 | 14 тур | Смена Комсомольск-на-Амуре | 1:1 Н | Дома | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 08.07.2011, Пт, 15:30 | 15 тур | Амур-2010 Благовещенск | 0:3 П | Выезд | Благовещенск | |
| 11.07.2011, Пн, 15:00 | 16 тур | Смена Комсомольск-на-Амуре | 0:2 П | Выезд | Комсомольск-на-Амуре | |
| 21.07.2011, Чт, 16:30 | 18 тур | Сибиряк Братск | 0:1 П | Выезд | Братск | |
| 08.08.2011, Пн, 18:00 | 19 тур | Якутия Якутск | 1:3 П | Дома | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 18.08.2011, Чт, 15:00 | 21 тур | Мостовик-Приморье Уссурийск | 0:1 П | Выезд | Уссурийск | |
| 21.08.2011, Вс, 14:30 | 22 тур | Сахалин Южно-Сахалинск | 1:3 П | Выезд | Южно-Сахалинск | |
| 28.08.2011, Вс, 18:00 | 23 тур | Динамо Барнаул | 2:2 Н | Дома | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 31.08.2011, Ср, 18:00 | 24 тур | Иртыш Омск | 2:1 В | Дома | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 07.09.2011, Ср, 16:00 | 25 тур | Радиан-Байкал Иркутск | 1:1 Н | Выезд | Иркутск, Стадион "Локомотив" | |
| 10.09.2011, Сб, 15:30 | 26 тур | Чита Чита | 1:1 Н | Выезд | Чита | |
| 18.09.2011, Вс, 17:00 | 27 тур | КУЗБАСС Кемерово | 2:0 В | Дома | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 21.09.2011, Ср, 19:00 | 28 тур | Металлург-Кузбасс Новокузнецк | 0:5 П | Дома | Новосибирск | |
| 28.09.2011, Ср, 18:30 | 29 тур | КУЗБАСС Кемерово | 1:7 П | Выезд | Кемерово, Стадион "Шахтер" | |
| 01.10.2011, Сб, 17:00 | 30 тур | Металлург-Кузбасс Новокузнецк | 1:3 П | Выезд | Новокузнецк | |
| 08.10.2011, Сб, 18:00 | 31 тур | Радиан-Байкал Иркутск | 0:0 Н | Дома | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 11.10.2011, Вт, 18:00 | 32 тур | Чита Чита | 1:1 Н | Дома | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 19.10.2011, Ср, 18:00 | 33 тур | Иртыш Омск | 1:4 П | Выезд | Омск, Футбольный манеж "Красная звезда" | |
| 22.10.2011, Сб, 15:00 | 34 тур | Динамо Барнаул | 1:1 Н | Выезд | Барнаул, Стадион "Динамо" | |
| 29.04.2012, Вс, 14:00 | 35 тур | Мостовик-Приморье Уссурийск | 0:2 П | Дома | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 02.05.2012, Ср | 36 тур | Сахалин Южно-Сахалинск | 0:1 П | Дома | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 09.05.2012, Ср | 37 тур | Якутия Якутск | 2:0 В | Дома | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 22.05.2012, Вт, 18:00 | 40 тур | Сибиряк Братск | ?-? | Дома | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 29.05.2012, Вт, 18:00 | 41 тур | Амур-2010 Благовещенск | ?-? | Дома | Новосибирск, Стадион "Спартак" | |
| 01.06.2012, Пт | 42 тур | Смена Комсомольск-на-Амуре | ?-? | Дома | Новосибирск | |
Указанное время матчей — барнаульское (МСК+3)